Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PICALMQ13492 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PICALMQ13492 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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