Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPA4Q13156 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPA4Q13156 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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