Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ECH1Q13011 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ECH1Q13011 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms