Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CSTF3Q12996 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CSTF3Q12996 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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