Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
AP1B1Q10567 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
AP1B1Q10567 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms