Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CD300CQ08708 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms