Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SOX4Q06945 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms