Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RUNX1T1Q06455 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RUNX1T1Q06455 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms