Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GBE1Q04446 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GBE1Q04446 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms