Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IFITM3Q01628 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IFITM3Q01628 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms