Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FAM193AP78312 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms