Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
RPS29P62273 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
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