Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RND3P61587 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RND3P61587 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND3P61587 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND3P61587 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND3P61587 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND3P61587 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RND3P61587 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RND3P61587 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RND3P61587 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RND3P61587 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms