Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS3AP61247 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS3AP61247 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS3AP61247 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RPS3AP61247 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RPS3AP61247 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms