Protein–RNA interactions for Protein: P58872

RHBDL3, Rhomboid-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL3P58872 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RHBDL3P58872 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RHBDL3P58872 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms