Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF3P57682 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF3P57682 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLF3P57682 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLF3P57682 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF3P57682 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF3P57682 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF3P57682 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF3P57682 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLF3P57682 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms