Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
UBASH3AP57075 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
UBASH3AP57075 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms