Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GRIA4P48058 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms