Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSN1S1P47710 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CSN1S1P47710 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CSN1S1P47710 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CSN1S1P47710 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSN1S1P47710 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CSN1S1P47710 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CSN1S1P47710 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms