Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTGDSP41222 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTGDSP41222 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms