Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
FDFT1P37268 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FDFT1P37268 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms