Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ACTN2P35609 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
ACTN2P35609 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms