Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
THBS4P35443 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
THBS4P35443 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
THBS4P35443 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
THBS4P35443 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms