Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HOXC13P31276 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXC13P31276 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms