Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
HOXA10P31260 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HOXA10P31260 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms