Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PEX2P28328 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PEX2P28328 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PEX2P28328 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms