Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SPI1P17947 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms