Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT10P13645 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT10P13645 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT10P13645 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT10P13645 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT10P13645 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
KRT10P13645 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRT10P13645 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
KRT10P13645 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
KRT10P13645 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
KRT10P13645 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRT10P13645 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms