Protein–RNA interactions for Protein: P12838

DEFA4, Neutrophil defensin 4, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA4P12838 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
DEFA4P12838 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms