Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SAA2P0DJI9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms