Protein–RNA interactions for Protein: O95342

ABCB11, Bile salt export pump, humanhuman

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB11O95342 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ABCB11O95342 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ABCB11O95342 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms