Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GABARAPO95166 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GABARAPO95166 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms