Protein–RNA interactions for Protein: O75503

CLN5, Ceroid-lipofuscinosis neuronal protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN5O75503 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN5O75503 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN5O75503 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN5O75503 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN5O75503 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN5O75503 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CLN5O75503 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CLN5O75503 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms