Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GADD45BO75293 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GADD45BO75293 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms