Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SIN3BO75182 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms