Protein–RNA interactions for Protein: O60575

SPINK4, Serine protease inhibitor Kazal-type 4, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINK4O60575 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SPINK4O60575 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SPINK4O60575 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SPINK4O60575 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK4O60575 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK4O60575 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK4O60575 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK4O60575 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SPINK4O60575 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SPINK4O60575 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SPINK4O60575 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms