Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HTATSF1O43719 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HTATSF1O43719 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms