Protein–RNA interactions for Protein: O15143

ARPC1B, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC1BO15143 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ARPC1BO15143 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms