Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
EBAG9O00559 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms