Protein–RNA interactions for Protein: J3QQQ9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QQQ9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
J3QQQ9 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QQQ9 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
J3QQQ9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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