Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
NPIPA5E9PKD4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NPIPA5E9PKD4 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms