Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
HACD1B0YJ81 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms