Protein–RNA interactions for Protein: A6NCE7

MAP1LC3B2, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3 beta 2, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3B2A6NCE7 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MAP1LC3B2A6NCE7 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms