Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTPDC1A2A3K4 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTPDC1A2A3K4 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms