Protein–RNA interactions for Protein: A0A0D9SFI3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0D9SFI3 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
A0A0D9SFI3 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
A0A0D9SFI3 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms