Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 CD164-203ENST00000324953 2936 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CLCN6-202ENST00000346436 5583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SIPA1L2-203ENST00000366630 6690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CNR2-201ENST00000374472 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TRIM5-201ENST00000380027 2290 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 SYBU-202ENST00000399066 3435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL160275.1-201ENST00000423632 476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CHN2-211ENST00000424025 2279 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC068137.1-201ENST00000429272 584 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 OR3B1P-201ENST00000437536 893 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PMS2CL-204ENST00000486256 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 HM13-224ENST00000498035 3932 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 PRB4-203ENST00000535904 796 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 AMBN-203ENST00000613447 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC135050.6-202ENST00000613584 392 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 HDAC6-203ENST00000376619 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 STK38-201ENST00000229812 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 CFAP44-201ENST00000295868 3377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ZNF471-201ENST00000308031 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 ZNF366-201ENST00000318442 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 BBS1-201ENST00000318312 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 SLC16A14-201ENST00000295190 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 CDH23-203ENST00000398788 4329 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC022509.1-202ENST00000537525 494 ntTSL 4 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AL035410.2-201ENST00000604963 864 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
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HOXD11P31277 AC073488.11-201ENST00000633298 754 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 TACC2-208ENST00000369001 3685 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 C14orf132-203ENST00000555004 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ZNF146-202ENST00000456324 3780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PMEL-206ENST00000548747 2757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 AC016876.2-201ENST00000581621 4554 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ARHGEF9-228ENST00000636926 5436 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 OTOA-201ENST00000286149 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MOB1A-201ENST00000396049 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ZSCAN31-202ENST00000396838 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 MFAP5-203ENST00000433590 2308 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 NTRK3-207ENST00000542733 2287 ntTSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 ANKRD18B-201ENST00000290943 3773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 FRMPD3-201ENST00000276185 7304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
HOXD11P31277 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
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