Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TMEM30CP-203ENST00000637814 1035 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 TNRC6B-206ENST00000454349 18279 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR9A2-201ENST00000350513 1038 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPL39-201ENST00000361575 401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-354P-201ENST00000383862 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-610P-201ENST00000384264 107 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC069540.1-201ENST00000446320 988 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GNPDA2-202ENST00000507534 1050 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MITF-217ENST00000531774 1074 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC079600.1-201ENST00000550326 297 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LCMT1-AS1-204ENST00000569920 474 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 GAS2L3-203ENST00000539410 2229 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
TRAPPC9Q96Q05 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.9 ms