Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR2052HG-203ENST00000523118 2125 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DNAJC5G-204ENST00000406962 1562 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CPEB4-209ENST00000522336 1551 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC005077.4-201ENST00000421546 3495 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CRIP3-201ENST00000274990 800 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MRPL55-211ENST00000366738 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GSTA5-202ENST00000370989 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL513164.1-201ENST00000423268 311 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC02022-201ENST00000448129 635 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC104843.1-201ENST00000451203 319 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC016968.1-201ENST00000479610 697 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 IGHVIII-51-1-201ENST00000519403 302 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC027369.4-201ENST00000534243 816 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC02310-201ENST00000556762 572 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 EDRF1-AS1-205ENST00000601363 712 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FLT1-208ENST00000617835 434 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 OR1B1-201ENST00000623530 995 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 LINC00598-216ENST00000638163 528 ntTSL 4 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ALG9-210ENST00000531154 1930 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 WSB1-209ENST00000581185 1900 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 POP1-201ENST00000349693 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 THNSL2-201ENST00000324166 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GOT2P1-201ENST00000440922 1309 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TP63-210ENST00000440651 2031 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 HDAC9-210ENST00000428307 2359 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CTAGE5-203ENST00000341502 4091 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF248-203ENST00000395867 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RSPH3-202ENST00000367069 6561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GDNF-AS1-205ENST00000637926 3819 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF558-207ENST00000601372 7032 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PKD1-203ENST00000423118 14135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DCAF7-205ENST00000614556 6340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CHRNA9-201ENST00000310169 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SMG6-202ENST00000354901 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GGA3-213ENST00000582486 2319 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC008507.5-201ENST00000624591 1969 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FAM60A-201ENST00000337682 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SCMH1-201ENST00000326197 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DSG4-202ENST00000359747 4526 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNA5SP301-201ENST00000362537 121 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FCAR-206ENST00000391724 762 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 PROX1-AS1-201ENST00000413560 496 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 Z83839.1-201ENST00000423412 630 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 KRTAP9-11P-201ENST00000431013 525 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL162386.2-201ENST00000442428 457 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL008627.1-201ENST00000446953 486 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC034206.1-201ENST00000509372 474 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AP002833.2-201ENST00000531585 462 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC133561.3-201ENST00000568778 351 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RN7SL49P-201ENST00000581392 298 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AC005086.2-201ENST00000624939 228 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NUGGC-201ENST00000413272 3887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TCF4-254ENST00000626584 1701 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TRIM10-203ENST00000376704 3007 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 SEC22B-201ENST00000578049 6922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF195-203ENST00000343338 3145 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 FNBP1-204ENST00000446176 5393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 METTL4-201ENST00000319888 3601 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AL138889.1-202ENST00000451317 3630 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TRPS1-201ENST00000220888 5480 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 UBQLN2-201ENST00000338222 4230 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZFYVE26-207ENST00000555452 7309 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 ZNF431-207ENST00000600692 1971 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 GADL1-202ENST00000454381 4509 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 TIA1-203ENST00000415783 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 DIP2C-202ENST00000381496 7749 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 AFF1-202ENST00000395146 9285 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CALU-206ENST00000542996 4225 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 C11orf57-209ENST00000532163 3739 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
HOXD11P31277 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.2 ms