Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AF117829.1-208ENST00000521996 915 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC091819.2-201ENST00000522292 490 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC134669.1-201ENST00000581275 672 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 BX005214.3-202ENST00000619809 325 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 TOPBP1-201ENST00000260810 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 BMS1P3-201ENST00000372011 932 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 YAF2-202ENST00000380790 1211 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL606970.4-201ENST00000424343 455 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 DSTNP5-201ENST00000427921 523 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC01363-202ENST00000428030 930 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TRAM2Q15035 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TRAM2Q15035 AP002981.1-201ENST00000517692 975 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TRAM2Q15035 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TRAM2Q15035 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 MTUS1-202ENST00000297488 3731 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
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TRAM2Q15035 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 FAM184A-212ENST00000522284 2721 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
TRAM2Q15035 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
TRAM2Q15035 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
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