Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR6

KRTAP3-3, Keratin-associated protein 3-3, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP3-3Q9BYR6 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SCMH1-207ENST00000372597 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AL354993.1-201ENST00000436286 3280 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC38A7-206ENST00000564100 2867 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SALRNA2-201ENST00000629082 2066 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CCL17-201ENST00000219244 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 HBG2-201ENST00000336906 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RNA5SP324-201ENST00000365177 108 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 MIR5689HG-201ENST00000366312 656 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RAB13-201ENST00000368575 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PDCL3P3-201ENST00000417487 715 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PFN1P3-201ENST00000443612 402 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PFN1P4-201ENST00000450970 402 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AL121721.1-201ENST00000460400 568 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC008453.1-201ENST00000511626 425 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SAA2-205ENST00000529528 610 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AP001107.8-201ENST00000530805 479 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AP001094.3-201ENST00000580491 616 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC009271.1-201ENST00000589440 518 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC073389.2-201ENST00000606726 571 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AP003419.3-201ENST00000613900 527 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC006581.2-201ENST00000631830 455 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 GRIA2-211ENST00000507898 3041 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ANKRD52-201ENST00000267116 8688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 EPHA6-201ENST00000389672 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 NCOA6-201ENST00000359003 7081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 GCNT1-203ENST00000444201 5476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ACAD11-201ENST00000264990 4142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 LILRB1-206ENST00000396332 2776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 LEMD1-AS1-201ENST00000447832 2781 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ADAMTS9-AS2-202ENST00000474768 2388 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CHMP2B-203ENST00000471660 2528 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 TAGAP-201ENST00000326965 3051 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 POLR2M-201ENST00000299638 4199 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SEMA4G-205ENST00000517724 2675 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CASP14-201ENST00000427043 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 EMG1-202ENST00000599672 4898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 BCL2L13-207ENST00000418951 5062 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PCDHGA8-202ENST00000610569 6480 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 SLC5A9-201ENST00000236495 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PIK3R5-209ENST00000581552 3253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 DAAM2-202ENST00000398904 6224 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 MADD-207ENST00000402799 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 TMEM75-201ENST00000624314 2165 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 MARS2-201ENST00000282276 3019 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 TRIM59-201ENST00000309784 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 NT5C1B-202ENST00000359846 2475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 THAP5-203ENST00000415914 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 UBN1-202ENST00000396658 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 MERTK-203ENST00000421804 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 DNAJC5G-202ENST00000402462 1904 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 HAP1-201ENST00000310778 4087 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 OR5T2-202ENST00000641661 2062 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CU634019.1-201ENST00000623095 2247 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CU633904.1-202ENST00000625096 2247 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CILP-201ENST00000261883 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 FAM111B-204ENST00000529618 2364 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 WTAP-202ENST00000358372 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AL035681.1-201ENST00000441316 2500 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 GPR55-201ENST00000392039 1523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 PCDHA9-201ENST00000378122 6900 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ENTPD7-201ENST00000370489 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 AC093909.4-201ENST00000514297 1991 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 BARD1-211ENST00000613706 4153 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 ADGRE3-202ENST00000344373 2267 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 TSNAXIP1-206ENST00000561639 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 FANCB-201ENST00000324138 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CFB-271ENST00000425368 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
KRTAP3-3Q9BYR6 CDC42SE1-207ENST00000540998 3181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.2 ms